Детектив Конан: Джолли Роджер в глубине лазури

События 11-ого фильма происходят на острове Коми в Тихом океане. Этот остров славится легендой о «Подводном дворце» - древних руинах на морском дне, где, по рассказам, были спрятаны сокровища двух реально существовавших женщин-пиратов Энн Бонни и Мэри Рид. Во время отпуска на этом острове Когоро, Конан, Ран и "Команда юных детективов" сталкиваются с охотниками за этими сокровищами. Очень скоро они оказываются втянуты в череду преступлений и поиски спрятанных богатств.