
Идзана Синатосэ — пилот-страж юнита № 723 на борту Сидонии. Она относится к «третьему полу», возникшему за сотни лет человеческой эмиграции в открытом космосе: её тело способно менять половую принадлежность в зависимости от партнёра, а также допускает бесполое размножение с созданием собственного клона. Идзана быстро сближается с Нагатэ Таникадзэ, становится его лучшим другом и проводником по повседневной жизни Сидонии. Постепенно дружба перерастает в романтическое чувство, и это запускает у Идзаны изменения тела. Со временем из-за влюблённости в Нагатэ её организм начинает непроизвольно «переключаться» на женский пол; позднее раскрывается, что она стала полноценной женщиной. Во время первого вылета Идзана теряет руку и ногу после столкновения с Бэнисудзумэ, но продолжает службу благодаря протезам, позволяющим выполнять сложные манипуляции с точностью, порой превосходящей возможности обычного человека. Её линия в истории сочетает бытовую близость с Нагатэ и напряжённую фронтовую реальность службы, подчёркивая, как в условиях космической изоляции меняются и тело, и чувства, и само представление о человеческой норме.
| По-русски | Идзана Синатосэ |
| По-японски | 科戸瀬 イザナ |
| По-английски | Izana Shinatose |