
Наоко Акаги была матерью Рицуко Акаги и создателем системы суперкомпьютеров Magi. Она работала над проектом «Е» вместе с Юи Икари и была бывшим главой технического отдела Gehirn. Её фамилия «Акаги» происходит от названия корабля императорского флота Японии, а имя «Наоко» заимствовано у подруги Хидэаки Анно. Внешне она описывается как брюнетка со средней длиной волос, темно-зелеными глазами и темными губами. Во время работы в Gehirn, Наоко стала любовницей Гэндо Икари, но после конфликта с первой Рей Аянами, поняла, что Гэндо просто пользовался её. В порыве гнева, Наоко задушила Рей, а затем либо совершила самоубийство, либо была убита при похожих на самоубийство обстоятельствах. В манге, Наоко совершает самоубийство сразу после убийства первой Рей, и Рицуко становится свидетельницей этих событий.
| По-русски | Наоко Акаги |
| По-японски | 赤木ナオコ |
| По-английски | Naoko Akagi |