Призрак в доспехах 2: Невинность — После долгого прощания

История, предшествующая событиям фильма «Призрак в доспехах 2: Невинность», рассказана от лица Бато — массивного модифицированного киборга, который неожиданно для себя начинает видеть сны и ловит отголоски чувств, больше похожих на человеческие, чем на работу «кибермозга». В прошлом его связывали чувства с Мотоко Кусанаги, но после её исчезновения из Девятого отдела у него остались лишь служба и верный пёс по кличке Габриэль. Однажды, возвращаясь домой после аварии, Бато обнаруживает, что Габриэль пропал. Поиски питомца затягивают его на криминальные улицы и одновременно заставляют столкнуться с собственными размышлениями о природе эмоций и о том, где проходит граница между машинным и человеческим. «После долгого прощания» — камерная, личная часть истории «Призрака в доспехах», в которой расследование превращается в путешествие по внутреннему миру Бато.